เจดีย์วัดฟ้าเวียงอินทร์นั้น แต่เดิมสันนิษฐานว่า สร้างในสมัยสมเด็จพระนเรศวรมหาราช เสด็จมาปราบศึกพม่าที่มารุกรานไทย พระองค์อาจสร้างเจดีย์ไว้ สันนิษฐานว่าอาจเป็นช่วงเดียวกับที่สร้างพระธาตุแสนไห
ไม่น่าจะใช่ จากรูปแบบทางศิลปกรรมของเจดีย์ทั้ง 2 องค์ มีรูปแบบศิลปกรรมไทใหญ่อย่างชัดเจน วัดฟ้าเวียงอินทร์ คงสร้างขึ้นราว พุทธศตวรรษที่ 25 (ประมาณ 2457 เป็นต้นมา) ซึ่งไม่พบโบราณวัตถุใดที่มีความเกี่ยวข้องกับกรุงศรีอยุธยาเลย แม้แต่โบราณวัตถุจากวัดพระธาตแสนไห ส่วนใหญ่มีความเกี่ยวข้องกับรูปแบบศิลปกรรมล้านนาแทบทั้งสิ้่น